单细胞转录组——SingleR自动注释
# The objective of this R script: Run SingleR # Author: Yuan.Sh# Date: 2021-10-07 17:07:34# Blog: https://blog.csdn.net/qq_40966210/category_11165022.html# Best Regards, # Yuan.Sh (Major in Bioinfomatics & Deep-learning)# —————————————# School of Basic Medical Sciences, # Fujian Medical University, # Fuzhou, Fujian, China. # please contact with me via the following ways: # (a) e-mail :yuansh3354@163.com # (b) QQ : 1044532817################################################################### # optionsrm(list=ls())dir()options(stringsAsFactors = F)options(as.is = T)gc()# packageslibrary(stringr)library(magrittr)library(SingleR)library(Seurat)# load dataload(\’/media/yuansh/14THHD/胰腺癌/pdac.RData\’)sce = sce.bigrm(sce.big)gc()# SingleRsce_for_SingleR
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